Tính đến hết năm học 2015-2016, huyện có 6 trường mẫu giáo, mầm non; 6 trường tiểu học; 3 trường THCS và 1 trường THPT. Nhận thức về công tác phổ cập giáo dục của cấp ủy, chính quyền địa phương có nhiều chuyển biến tích cực; tình hình KT- XH tiếp tục ổn định và phát triển, đời sống nhân dân ngày được nâng lên đã tạo điều kiện thuận lợi để học sinh ra học ở các lớp.
Năm 2016, huyện Phú Quý đã tăng cường các biện pháp nâng cao chất lượng giáo dục phổ thông, củng cố kết quả phổ cập giáo dục, xóa mù chữ. Kết quả, đã huy động 100% số trẻ 5 tuổi đến lớp, 3/3 xã, đạt chuẩn phổ cập giáo dục tiểu học mức độ 3; 1/3 xã đạt chuẩn phổ cập giáo dục THCS mức độ 2.
Qua kiểm tra, Đoàn đã đánh giá cao công tác phổ cập giáo dục, xóa mù chữ của huyện và đề nghị thời gian tới huyện cần tiến hành rà soát, đánh giá về hệ thống cơ sơ vật chất trường lớp học, từ đó có phương án tham mưu đầu tư, đẩy mạnh việc xây dựng cơ sở vật chất để đáp ứng được các điều kiện cho dạy và học; tiếp tục duy trì các mức độ đã đạt được, phấn đấu đạt chuẩn PCDG xóa mù chữ mức độ 2; đẩy mạnh công tác bồi dưỡng chuyên môn, nghiệp vụ cho đội ngũ giáo viên, đầu tư đầy đủ trang thiết bị, phục vụ cho việc đổi mới phương thức giảng dạy; quan tâm xây dựng cảnh quan, tổ chức tốt các phong trào thi đua tạo môi trường thân thiện – tích cực, thu hút học sinh đến trường.